Молодая тайваньская наемница по прозвищу Стеклянное Сердце решает свести счеты с жизнью, бросившись с крыши. Но судьба распоряжается иначе — вместо смерти она получает тяжелое ранение, повредив сердце о металлический забор. Врачи спасают ей жизнь, пересадив донорское сердце. Во время комы девушку преследуют загадочные видения, которые впоследствии приводят ее в Японию. Там она начинает поиски человека, чье сердце теперь бьется в ее груди — Каори Макимуры, бывшей напарницы знаменитого Городского Охотника Рё Саэбы.
История разворачивается в альтернативной реальности, где знакомые персонажи из "Городского Охотника" живут совершенно другими судьбами. Хотя герои сохраняют свои узнаваемые черты, их характеры и взаимоотношения переосмыслены. Сюжет не является прямым продолжением оригинальной манги, а скорее предлагает новую интерпретацию вселенной, созданной Цукасой Ходзё. Здесь нет привычных связей с прошлым, только отголоски воспоминаний и снов, которые ведут главную героиню к разгадке тайны ее нового сердца.
Путешествие Стеклянного Сердца наполнено драматизмом и мистикой. Ее сны, полные неясных образов и эмоций, становятся ключом к пониманию собственной судьбы. Встреча с Рё Саэбой и другими персонажами открывает перед ней мир, где прошлое и настоящее переплетаются. Но сможет ли она принять свое новое "я" или так и останется пленницей чужой памяти? Ответ на этот вопрос ищет не только она, но и те, кто окружает ее в этом странном, но удивительно живом мире.